Geïsoleerde marge verwijst naar een handelsmechanisme dat de hoeveelheid onderpand die beschikbaar is voor een specifieke positie beperkt tot een specifieke margerekening. In deze opzet lopen alleen de fondsen die aan die transactie zijn toegewezen risico, waardoor de rest van het kapitaal van de handelaar wordt beschermd tegen verliezen. Als een handelaar bijvoorbeeld een hefboompositie opent met een geïsoleerde marge, is de marge die hij of zij aanwijst het maximale bedrag dat kan worden gebruikt om potentiële verliezen voor die transactie te dekken. Als de positie tegenvalt, gaan alleen de fondsen op die specifieke margerekening verloren, terwijl andere activa op andere rekeningen onaangetast blijven. Deze aanpak staat in contrast met cross margin, waarbij beschikbare fondsen op alle rekeningen kunnen worden gebruikt om verliezen op elke positie te dekken. Geïsoleerde marge wordt vaak verkozen door handelaren die risico's effectiever willen beheren, omdat het hen helpt om binnen hun gespecificeerde risicotolerantie voor individuele transacties te blijven.